MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017058	AGT	3	9	373	381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500937
2	NC_017058	AT	3	6	400	405	50 %	50 %	0 %	0 %	383500937
3	NC_017058	GATAAA	2	12	536	547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383500937
4	NC_017058	ATGCT	2	10	561	570	20 %	40 %	20 %	20 %	383500937
5	NC_017058	TAG	2	6	599	604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500937
6	NC_017058	TC	3	6	1015	1020	0 %	50 %	0 %	50 %	383500938
7	NC_017058	ATA	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500938
8	NC_017058	ACG	2	6	1072	1077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500938
9	NC_017058	ACT	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500938
10	NC_017058	TAC	2	6	1093	1098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500938
11	NC_017058	AAGA	2	8	1175	1182	75 %	0 %	25 %	0 %	383500938
12	NC_017058	AAT	2	6	1282	1287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500938
13	NC_017058	T	7	7	1332	1338	0 %	100 %	0 %	0 %	383500938
14	NC_017058	AAT	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500938
15	NC_017058	T	7	7	1392	1398	0 %	100 %	0 %	0 %	383500938
16	NC_017058	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	383500939
17	NC_017058	ATTA	2	8	1479	1486	50 %	50 %	0 %	0 %	383500939
18	NC_017058	TA	3	6	1550	1555	50 %	50 %	0 %	0 %	383500939
19	NC_017058	GCCC	2	8	1568	1575	0 %	0 %	25 %	75 %	383500939
20	NC_017058	TCT	2	6	1588	1593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500939
21	NC_017058	AGA	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500939
22	NC_017058	AGT	2	6	1642	1647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500939
23	NC_017058	CCG	2	6	1687	1692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383500939
24	NC_017058	T	6	6	1795	1800	0 %	100 %	0 %	0 %	383500939
25	NC_017058	CCA	2	6	1939	1944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500939
26	NC_017058	TCA	3	9	1951	1959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500939
27	NC_017058	TTAG	2	8	1972	1979	25 %	50 %	25 %	0 %	383500939
28	NC_017058	CAT	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500939
29	NC_017058	AAG	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500939
30	NC_017058	TAATT	2	10	2158	2167	40 %	60 %	0 %	0 %	383500940
31	NC_017058	CACC	2	8	2176	2183	25 %	0 %	0 %	75 %	383500940
32	NC_017058	TTTTC	2	10	2194	2203	0 %	80 %	0 %	20 %	383500940
33	NC_017058	T	6	6	2208	2213	0 %	100 %	0 %	0 %	383500940
34	NC_017058	AGC	3	9	2214	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500940
35	NC_017058	CAC	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500940
36	NC_017058	TTG	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500940
37	NC_017058	TA	3	6	2319	2324	50 %	50 %	0 %	0 %	383500940
38	NC_017058	CTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500940
39	NC_017058	TTGC	2	8	2387	2394	0 %	50 %	25 %	25 %	383500940
40	NC_017058	CTG	3	9	2423	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500940
41	NC_017058	TCTT	2	8	2475	2482	0 %	75 %	0 %	25 %	383500941
42	NC_017058	TTA	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500941
43	NC_017058	CTTT	2	8	2542	2549	0 %	75 %	0 %	25 %	383500941
44	NC_017058	TCA	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
45	NC_017058	GAT	2	6	2712	2717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500942
46	NC_017058	TTA	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500942
47	NC_017058	T	7	7	2785	2791	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
48	NC_017058	T	6	6	2794	2799	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
49	NC_017058	CAT	2	6	2801	2806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
50	NC_017058	ATC	2	6	2842	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
51	NC_017058	CAG	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500942
52	NC_017058	CAAT	2	8	2896	2903	50 %	25 %	0 %	25 %	383500942
53	NC_017058	GCA	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500942
54	NC_017058	CTT	2	6	3048	3053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500942
55	NC_017058	ATA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500942
56	NC_017058	TTTC	2	8	3071	3078	0 %	75 %	0 %	25 %	383500942
57	NC_017058	ACA	2	6	3107	3112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383500942
58	NC_017058	CAT	2	6	3147	3152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
59	NC_017058	ACT	2	6	3219	3224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
60	NC_017058	CTA	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
61	NC_017058	ATA	2	6	3348	3353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500942
62	NC_017058	T	6	6	3354	3359	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
63	NC_017058	ACG	2	6	3404	3409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500942
64	NC_017058	GAA	2	6	3449	3454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500942
65	NC_017058	TTA	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500942
66	NC_017058	T	6	6	3562	3567	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
67	NC_017058	T	6	6	3618	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
68	NC_017058	CCA	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500942
69	NC_017058	ATCA	2	8	3642	3649	50 %	25 %	0 %	25 %	383500942
70	NC_017058	CAT	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
71	NC_017058	TTTA	2	8	3696	3703	25 %	75 %	0 %	0 %	383500942
72	NC_017058	ATA	2	6	3710	3715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500942
73	NC_017058	A	7	7	3736	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	383500942
74	NC_017058	TAT	2	6	3743	3748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500942
75	NC_017058	T	6	6	3765	3770	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
76	NC_017058	ACA	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383500942
77	NC_017058	ATT	2	6	3843	3848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500943
78	NC_017058	TAAA	2	8	3887	3894	75 %	25 %	0 %	0 %	383500943
79	NC_017058	ATA	2	6	3953	3958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500943
80	NC_017058	GCT	2	6	4014	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
81	NC_017058	TAC	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500943
82	NC_017058	AT	3	6	4059	4064	50 %	50 %	0 %	0 %	383500943
83	NC_017058	GAA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500943
84	NC_017058	GCA	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500943
85	NC_017058	CTG	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
86	NC_017058	TCT	2	6	4274	4279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500943
87	NC_017058	TCT	2	6	4328	4333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500943
88	NC_017058	AGC	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500943
89	NC_017058	TAA	2	6	4365	4370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500943
90	NC_017058	CGT	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
91	NC_017058	TCA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500943
92	NC_017058	ATA	2	6	4496	4501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500943
93	NC_017058	T	8	8	4515	4522	0 %	100 %	0 %	0 %	383500943
94	NC_017058	T	7	7	4537	4543	0 %	100 %	0 %	0 %	383500943
95	NC_017058	GCT	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
96	NC_017058	ATT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500943
97	NC_017058	TTA	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500943
98	NC_017058	ACT	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500943
99	NC_017058	TGC	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
100	NC_017058	TCA	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500943
101	NC_017058	TC	3	6	4808	4813	0 %	50 %	0 %	50 %	383500943
102	NC_017058	GGA	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383500943
103	NC_017058	AGT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500943
104	NC_017058	A	6	6	4859	4864	100 %	0 %	0 %	0 %	383500943
105	NC_017058	TAT	2	6	4873	4878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500943
106	NC_017058	TGT	2	6	4880	4885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500943
107	NC_017058	T	6	6	4885	4890	0 %	100 %	0 %	0 %	383500943
108	NC_017058	TAT	2	6	5072	5077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500944
109	NC_017058	ATT	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500944
110	NC_017058	TAT	2	6	5140	5145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500944
111	NC_017058	ATA	2	6	5182	5187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500944
112	NC_017058	TAT	2	6	5212	5217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500944
113	NC_017058	TCT	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500945
114	NC_017058	TATT	2	8	5616	5623	25 %	75 %	0 %	0 %	383500945
115	NC_017058	GATC	2	8	5629	5636	25 %	25 %	25 %	25 %	383500945
116	NC_017058	GCTT	2	8	5661	5668	0 %	50 %	25 %	25 %	383500945
117	NC_017058	TATTT	2	10	5678	5687	20 %	80 %	0 %	0 %	383500945
118	NC_017058	TTA	2	6	5733	5738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500945
119	NC_017058	ATCTC	2	10	5829	5838	20 %	40 %	0 %	40 %	383500945
120	NC_017058	ATA	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500945
121	NC_017058	CGA	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500945
122	NC_017058	AT	3	6	5928	5933	50 %	50 %	0 %	0 %	383500945
123	NC_017058	TATC	2	8	5974	5981	25 %	50 %	0 %	25 %	383500945
124	NC_017058	CAT	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500945
125	NC_017058	CTA	2	6	6063	6068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500945
126	NC_017058	CTTT	2	8	6086	6093	0 %	75 %	0 %	25 %	383500945
127	NC_017058	ATA	2	6	6107	6112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500945
128	NC_017058	ATA	2	6	6166	6171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500945
129	NC_017058	AGC	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500945
130	NC_017058	TTA	2	6	6198	6203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500945
131	NC_017058	TTC	2	6	6218	6223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500945
132	NC_017058	CTC	2	6	6370	6375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383500945
133	NC_017058	AT	3	6	6398	6403	50 %	50 %	0 %	0 %	383500945
134	NC_017058	T	6	6	6403	6408	0 %	100 %	0 %	0 %	383500945
135	NC_017058	TCT	2	6	6429	6434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500945
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397	NC_017058	GGA	2	6	18025	18030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383500949
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